プロローグかつてこの世界には人々やポケモンを恐怖に陥れた組織があった。ロケット団、アクア団、マグマ団、ギンガ団、そしてプラズマ団。彼らは乱暴な手段で世界征服やポケモンの解放などを訴えていた。だがその野望は、二人の少年少女によって阻まれた。二人はそれぞれの地方で力を合わせて次々と組織を壊滅していった。そして今、新たな野望が世界を襲う…！
