−第一章−今はおよそ840年後の未来の日本。年々水位が増していき、大半の平地は海の底となった。多くの人は、家の上に家を、さらにその上に家を建てるようにしていったため、大きなコロニーでは、巨大水上都市が出来上がる程であった。——いつの間にか、ココは日本であって、日本でないトコロになりつつある。そんな各地にいくつも点在する巨大水上都市の1つ『シーウェポン』その中央を陣取るように建つ『神無黎明私立高等学院』の1学年フロアは普段より五割増しで騒がしいのであった。